秦可卿的病因，成了《红楼梦》中最大的谜团。根据尤氏的描述，怎么看怎么样像是怀了孕：“她这些日子不知是怎么着，经期有两个月没来，叫大夫瞧了，又说并不是喜，那两日，到了下半天就懒怠动，话也懒怠说，眼神也发眩……”

听了尤氏的描述，那位一心要来找秦可卿麻烦的璜大奶奶，早已吓得不敢再说金荣的事，反而安慰尤氏：“我们这么听着，实在也没见人说有个好大夫，如今听起大奶奶这个来，定不得还是喜呢，嫂子倒别教人混治，倘或认错了，这可是了不得的。”
事实上，秦可卿的病症，不仅璜大奶奶认为可能是“喜”，就连邢夫人也认为可能是“喜”。贾敬生日的时候，尤氏把秦可卿的病症，又向邢夫人、王夫人和王熙凤，详细描述了一番，邢夫人立刻接着说：“别是喜罢？”
而且，也有大夫认为秦可卿的病，是“喜”，秦可卿生病的婆子告诉张友士：“如今我们家里好几位太医老爷瞧着呢……有一位说是喜，有一位说是病，这位说不相干，那位说怕冬至……”

秦可卿和贾蓉早已成亲，两人膝下无子，如果这时候秦可卿有了身孕，岂不是一件大好事？可是，事情还牵扯到另一个问题，因为焦大早就在第七回，就嚷出来一句至关重要的话，“爬灰的爬灰”，毫无疑问，这句话指的正是贾珍和秦可卿。如果秦可卿有了身孕，而宁国府中又不愿意承认，那么很有可能，这个孩子不是贾蓉的，反而是贾珍的。
秦可卿的病，究竟是不是喜？她是不是真的怀上了贾珍的孩子？而这件事也就成了宁国府中不能说的秘密？所以，那些了解真相的大夫们，才会不敢说出秦可卿的真正病因？
那位被贾珍郑重其事地请过来的张友士，说了真话：“大奶奶这个症候，可是众位耽搁了，若是在初次行经的时候就用药治起来，不但断无今日之患，而且此时已痊愈了，如今既把病耽搁到这个地步，也是应有此灾，依我看来，这病尚有三分治得……”

所以，秦可卿的病，终究并非是喜，更不是怀里贾珍的孩子。秦可卿的前世，乃是太虚幻境警幻仙姑的妹妹，本来就是为了引领贾宝玉到太虚幻境中走一遭，完成了自己的使命，终归还是要回到太虚幻境中去的，她不可能与贾蓉亦或者是贾珍有孩子。本来《红楼梦》就具有一定的神话色彩，这些女子，都是陪着贾宝玉和林黛玉到人世间“造历幻缘”的。
那么，既然秦可卿不是怀孕，究竟又是什么病呢？其实，周瑞家的曾经在第一次见到香菱的时候，说了一句话，说香菱和秦可卿长得非常像。这两个女子之间，究竟有什么关系？正是因为秦可卿的病和香菱的病，非常相似。

两个人的病都是经血不行，都是形容消瘦，都是懒进饮食，两个人又都是婚后多年，却没有孩子的。所以，秦可卿的病，其实背后还隐藏着一个令人心惊的真相——这不仅是秦可卿的死因，还是香菱的死因。这两个不幸的女子，终究都只不过是无辜的牺牲品，秦可卿成为贾珍的玩物，香菱成为薛蟠的玩物。